次氯酸鈉與次氯酸因為僅僅只是一字之差，因此很多人經常把兩者混淆，甚至下意識的認為它們是一樣東西，其實它們之間可是有著天壤之別！
1、首先最基本的化學方程式就不一樣，說明它們的成分就不同
次氯酸 代表：HClO
次氯酸鈉 代表：NaClO
2、殺菌原理
1)次氯酸分解形成新生態氧o，新生態氧的*氧化性使菌體和病毒上的蛋白質等物質變性，從而致死病原微生物。
在殺菌、殺病毒過程中，不僅可作用于細胞壁、病毒外殼，而且因次氯酸分子小，不帶電荷，還可滲透入菌體內，氧化RNA或DNA，迅速滅活原核細胞使其死亡（細菌、真菌、支原體、衣原體、病毒和細菌芽孢等致病微生物均為原核細胞）。同時，次氯酸產生出的氯離子還能顯著改變細菌和病毒體的滲透壓，使其細胞喪失活性而死亡。
2)次氯酸鈉通過水解形成次氯酸，次氯酸再進一步分解形成新生態氧o，新生態氧的*氧化性使菌體和病毒上的蛋白質等物質變性，從而致死病原微生物。因此，由于次氯酸溶液具有高次氯酸分子豐度比，因此它表現出比次氯酸鈉遠遠高出的殺菌效果。
3、從安全性上看差異還是很大的
次氯酸：近人體酸堿度PH值，無色無味，溫和無刺激，可直接接觸皮膚，孕婦、老幼、敏感肌皆適宜。次氯酸來自人體，是人體白血球產生的天然抗菌物質，被用來殺死入侵的微生物病原體，也是先天免疫系統的一部分，無細胞毒性，作用后直接還原為水。無毒無害，對皮膚、粘膜、眼睛均無刺激。
次氯酸鈉：有刺激性氣味，具有腐蝕性，不能和醋、潔廁靈、洗衣粉等清潔產品混用，混合后會產生有毒氯氣。水解的過程會產生游離氯，游離氯與有機物質結合，形成致癌物質。次氯酸鈉屬強堿性，會對人體呼吸道、手、皮膚等人體造成腐蝕和損害，危害人體健康。
4、使用方式也有所不同
次氯酸：可直接使用，無需調配和勾兌，使用時無需佩戴防護措施。它的成分穩定，可大面積噴灑、可涂抹浸泡、可免洗、可直接接觸皮膚，無安全隱患。
次氯酸鈉：通常需要手動，按比例進行稀釋使用，且稀釋過程中需佩戴防護措施。此外，使用次氯酸鈉消毒時，應避免小孩、老人在場，并保持室內空氣流通，在作用半小時后用水清洗，去除消毒殘留。
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